30 janvier 2020

Origine du coronavirus


Le marché des fruits de mer de Wuhan n'est peut-être pas à l'origine de la propagation d'un nouveau virus à l'échelle mondiale

Alors que les cas confirmés d'un nouveau virus envahissent le monde à une vitesse inquiétante, tous les yeux se sont jusqu'à présent concentrés sur un marché de fruits de mer à Wuhan, en Chine, à l'origine de l'épidémie. Mais une description des premiers cas cliniques publiés dans The Lancet vendredi remet en question cette hypothèse.

Le document, rédigé par un grand groupe de chercheurs chinois de plusieurs institutions, fournit des détails sur les 41 premiers patients hospitalisés qui avaient confirmé des infections par ce qui a été surnommé le nouveau coronavirus 2019 (2019-nCoV). Dans le premier cas, le patient est tombé malade le 1er décembre 2019 et n'avait aucun lien signalé avec le marché des fruits de mer, rapportent les auteurs. "Aucun lien épidémiologique n'a été trouvé entre le premier patient et les cas ultérieurs", déclarent-ils. Leurs données montrent également qu'au total, 13 des 41 cas n'avaient aucun lien avec le marché. «C'est un grand nombre, 13 cas sans lien», explique Daniel Lucey, spécialiste des maladies infectieuses à l'Université de Georgetown.

Des rapports antérieurs des autorités sanitaires chinoises et de l' Organisation mondiale de la santé avaient indiqué que le premier patient avait des symptômes le 8 décembre 2019 - et ces rapports indiquaient simplement que la plupart des cas étaient liés au marché des fruits de mer, qui a été fermé le 1er janvier.

Lucey dit que si les nouvelles données sont exactes, les premières infections humaines doivent avoir eu lieu en novembre 2019 - sinon plus tôt - car il y a un temps d'incubation entre l'infection et les symptômes. Si tel est le cas, le virus pourrait se propager silencieusement entre les habitants de Wuhan - et peut-être ailleurs - avant que le groupe de cas du désormais tristement célèbre Huanan Seafood Wholesale Market de la ville ne soit découvert fin décembre. «Le virus est entré sur ce marché avant de sortir de ce marché», affirme Lucey.

Les données du journal Lancet soulèvent également des questions sur l'exactitude des informations initiales fournies par la Chine, a déclaré Lucey. Au début de l'épidémie, la principale source officielle d'information du public était des avis de la Wuhan Municipal Health Commission. Ses avis du 11 janvier ont commencé à faire référence aux 41 patients comme les seuls cas confirmés et le nombre est resté le même jusqu'au 18 janvier.. Les avis n'indiquaient pas que le marché des fruits de mer en était la source, mais ils ont noté à plusieurs reprises qu'il n'y avait aucune preuve de transmission interhumaine et que la plupart des cas étaient liés au marché. Parce que la Commission de la santé municipale de Wuhan a noté que les tests de diagnostic avaient confirmé ces 41 cas au 10 janvier et que les responsables connaissaient vraisemblablement les antécédents de chaque patient, «la Chine doit avoir réalisé que l'épidémie n'était pas originaire de ce marché de fruits de mer de Wuhan Huanan», a déclaré Lucey à Science Insider. (Lucey a également fait part de ses préoccupations dans une interview publiée en ligne hier par Science Speaks , un projet de l'Infectious Disease Society of America.)

Kristian Andersen, biologiste évolutionniste au Scripps Research Institute qui a analysé des séquences de 2019-nCoV pour essayer de clarifier son origine, a déclaré que la date du 1er décembre pour le premier cas confirmé était `` une information intéressante '' dans The Lancet paper. «Le scénario selon lequel une personne est infectée en dehors du marché et infecte ensuite le marché est l'un des trois scénarios que nous avons envisagés et qui est toujours cohérent avec les données», dit-il. «C'est tout à fait plausible compte tenu de nos données et connaissances actuelles.» Les deux autres scénarios sont que l'origine était un groupe d'animaux infectés ou un seul animal qui est entré sur ce marché.

Andersen a publié son analyse de 27 génomes disponibles de 2019-nCoV le 25 janvier sur un site de recherche en virologie. Cela suggère qu'ils avaient un «ancêtre commun le plus récent» - c'est-à-dire une source commune - dès le 1er octobre 2019.

Bin Cao de Capital Medical University, l'auteur correspondant de l' article du Lancet et un spécialiste des maladies pulmonaires, a écrit dans un courriel à Science Insider que lui et ses co-auteurs "apprécient la critique" de Lucey.

"Maintenant, il semble clair que [le] marché des fruits de mer n'est pas la seule origine du virus", écrit-il. "Mais pour être honnête, nous ne savons toujours pas d'où vient le virus."
[...]


Source: Sciencemag
Traduction: Fawkes News

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